Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms