Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms