Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM43BA6NCK2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43BA6NCK2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43BA6NCK2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms