Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC26A0AVF1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC26A0AVF1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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