Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC196A0A1B0GTZ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms