Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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