Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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