Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms