Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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