Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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