Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP2C1P98194 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP2C1P98194 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms