Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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