Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms