Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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