Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC008870.1-201ENST00000566996 3009 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CKMT2-AS1-201ENST00000500148 2224 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 AL359547.1-201ENST00000419168 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TTI2-201ENST00000360742 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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