Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms