Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MAGEC3-201ENST00000298296 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 EIF2A-214ENST00000487799 1913 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TRIM2-209ENST00000494872 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CIITA-202ENST00000381835 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SERPINA10-202ENST00000393096 2451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC023449.2-201ENST00000620538 2400 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CU633980.1-201ENST00000613894 1708 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 Z95114.4-201ENST00000623420 3578 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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