Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms