Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms