Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms