Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms