Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CYP17A1-AS1-201ENST00000369884 491 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MAPK12-202ENST00000395778 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RPS19P7-201ENST00000455650 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC009086.1-201ENST00000567219 309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC009088.4-201ENST00000575892 280 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 UFSP2-201ENST00000264689 1630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AL355357.1-203ENST00000402154 639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MSMP-202ENST00000436428 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MAJIN-204ENST00000530444 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC011092.1-201ENST00000533128 1047 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LINC01702-203ENST00000635350 745 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MOG-217ENST00000376891 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MOG-219ENST00000376898 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MOG-222ENST00000396701 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MOG-223ENST00000396704 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms