Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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