Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms