Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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