Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms