Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms