Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms