Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms