Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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