Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms