Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 BOC-215ENST00000495514 4646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms