Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC00857-201ENST00000422847 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FAM13C-202ENST00000435852 2088 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms