Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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