Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 IRF5-201ENST00000249375 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms