Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms