Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms