Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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