Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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