Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms