Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJA3Q9Y6H8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJA3Q9Y6H8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA3Q9Y6H8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms