Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD54BQ9Y620 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms