Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3HQ9Y535 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3HQ9Y535 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3HQ9Y535 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3HQ9Y535 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3HQ9Y535 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms