Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms