Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q5

LAMTOR2, Ragulator complex protein LAMTOR2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR2Q9Y2Q5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR2Q9Y2Q5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR2Q9Y2Q5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms