Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POMPQ9Y244 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms