Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms