Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCML2Q9UQR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms