Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC5Q9UQL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms