Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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