Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX6Q9UNH7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms